本发明公开了一种交通枢纽港站中的出租车长短途自动分流的方法及系统,相关方法包括:当出租车返回交通枢纽港站的出租车排队系统入口时,获取该出租车的车牌号码,并根据该出租车的上一次行驶的GPS轨迹信息及行驶时间,判断该出租车是否满足短途行驶条件;若满足,则对该出租车进行短途分流,通过诱导显示屏提示该出租车进入短途出租车排队区域,并开启相应的道闸栏杆;若不满足,则对该出租车进行长途分流,通过诱导显示屏提示该出租车进入长途出租车排队区域,并开启相应的道闸栏杆。本发明公开的方法及系统,可以减少人工参与度,提升长短途行驶判定的准确率,减少进而避免纠纷的发生,提升交通枢纽港站中乘客疏散的效率和工作效率。