棉秆资源化综合利用技术是一项无公害、无污染、资源节约型的高效秸秆利用技术，将棉秆进行皮芯分离后，采用先进的三级连续水循环生物脱胶技术对棉秆皮进行脱胶，生产可用于纺织、造纸或其它工业用途的纤维产品；脱胶废水与棉秆皮以外的有机物混合作为食用菌的栽培料，采用国内领先的食用菌工厂化生产技术，生产各种高档食用菌产品，生产食用菌后的有机质经过配料、发酵生产有机肥。

该集成技术包括三级连续水循环生物脱胶技术、食用菌工厂化生产技术和农作物有机肥生产技术等三方面： 三级连续水循环生物脱胶技术采用菌种回流连续培养工艺对果胶酶菌株进行培养，采用物料逆流运行的三级连续工艺对棉秆皮进行生物脱胶。目前，该技术已完成实验室研究，需要在建设过程中进行工厂化实验，进一步确定工业生产中的运行参数。 食用菌工厂化生产技术采用二级连续培养生产液体菌种，逆流风冷无菌冷却工艺对培养基进行冷却，子实体定向诱导技术对食用菌进行出菇管理。

目前，该技术成果已在年产1000吨和1500吨规模杏鲍菇的工厂化生产中应用，各项技术经济指标运行良好，获湖南省科技进步奖三等奖。 农作物有机肥生产技术将生产食用菌后的培养基残渣用于生产有机肥，实现生产原料的全利用和污染零排放。该技术已申请专利并通过国家专利局的初步审查。