本园目前共收集荷花品种242个，其中包括大洒锦、小洒锦、千瓣莲、友谊牡丹莲等稀有的品种，建立了西北地区第一个荷花种质资源圃；收集睡莲品种80余个，建立了西北地区第一个睡莲种质资源圃，并在国内首次对睡莲地下茎进行系统分类，总结出Lotos亚属睡莲在北方的地下茎越冬贮藏技术，培育出了我国首批Lotos睡莲亚属新品种2个‘貂婵’和‘西施’（Nympheae‘Xishi’和Nympheae‘Diaochan’），“睡莲科植物种质资源的收集、保存及新品种选育”荣获第七届中国花卉博览会科技成果新品种选育类铜奖；现已总结出一套王莲在我国北方的栽培技术，解决了以往王莲种苗一直依靠外购的问题。2010年，西安植物园培育的王莲叶片直径达到了290㎝，创造新的世界王莲叶片直径记录。
