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主要有三个方面的应用：
1).在基础研究方面，生物芯片主要用于基因测序以及基因功能的研究，最终将在基因水平上揭示生命的奥秘；
2).在医学上，生物芯片可用于研究导致人类各种疾病的基因缺陷，为疾病的诊断和新药的研制提供科学的依据和指导；
3).在农业和林业中，生物芯片可以帮助更好地了解植物生长和发育的根本机理，促进动物育种和植物新品种的产生。
