本发明公开了一种用于仪器管理系统的刷卡控制器高效计费方法,一方面,该方法在支持每台仪器有多个计费项目可选的同时,通过预约信息和刷卡开机时直接在刷卡控制器端操作选择的方式确定计费项目和参数,避免了使用仪器后需要手动修改原计费记录的现状,显著提升了工作效率,有利于智能化仪器管理系统的推广;另一方面,优化了用户使用流程、数据录入方式、刷卡控制器及Web端功能等多个方面,尽最大可能的简化了用户和管理者操作,特别是在刷卡控制器端直接操作选择当前计费项目和输入参数的方式,解决了现有技术中要事后到计算机Web端去选择和修改计费的麻烦,极大的方便了用户和管理员,防止了事后遗忘无法准确录入信息情况的发生。