本发明公开了一种基于全数字化技术的束流位置和相位测量系统及方法,该系统包括模拟前端部分和数字处理部分,模拟前端部分利用欠采样技术对来自束流位置探测器的输入信号进行欠采样,通过数字化控制的锁相环精确调节采样率,使之为束流位置探测器输入信号欠采样后数字中频信号频率的4倍,直接获取束流位置探测器输入信号的数字正交序列;数字处理部分对模拟前端部分采样获取的数字正交序列进行数字处理,同时测量加速器束流位置和相位,并实现相位的实时在线修正。本发明将数字处理模块集中在单片FPGA中,大大简化了系统结构。同时恰当的采样率,使得经过ADC采样后直接得到输入信号的正交序列,大大简化了信号的相位和幅度的数字处理算法。