本发明提供了一种高效的反硝化厌氧甲烷氧化与厌氧氨氧化混合微生物体系的共培养方法,其包括(1)富集含有DAMO和ANAMMOX微生物菌群,得到预共培养体系;(2)将培养步骤(1)得到的预共培养体系微生物,接种到添加了液体石蜡的培养基的反应器中,并在培养过程中添加硝氮NO3??N、甲烷CH4和氨氮NH4+?N,最终得到高活性的DAMO和ANAMMOX的混合微生物。本发明提供的共培养方法,不需要额外曝气,也不需要外加有机碳源,既节约了成本又避免了二次污染。用本发明方法培养得到的体系能够将CH4氧化成CO2,同时将NO3?和NH4+转化成N2排出,在含有氨氮、溶解甲烷的废水处理系统中有很好的应用前景。