本发明涉及一种独一味中五种苯丙素苷类单体化合物的分离制备方法,该方法包括以下步骤:⑴粉碎的独一味全草用酒精进行热回流提取,合并得到提取液;⑵提取液经减压蒸干至恒重,即得独一味提取物;⑶独一味提取物用去离子水溶解后依次用石油醚、乙酸乙酯、正丁醇萃取,得到正丁醇萃取液;该正丁醇萃取液减压蒸干至恒重,即得正丁醇萃取物;⑷正丁醇萃取物溶于水并上D101大孔树脂柱洗脱,得到含有苯丙素苷类物质的洗脱液;⑸洗脱液蒸干至恒重,即得苯丙素苷粗提物;⑹苯丙素苷粗提物采用高速逆流色谱设备,在乙酸乙酯-正丁醇-水体系中进行分离,即可分别得到连翘酯苷B、毛蕊花糖苷、alyssonoside、异毛蕊花糖苷和leucosceptoside?B。本发明简便、快速、成本低廉。