专利详情

专利名称	一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法
申请号	CN201610905670.7	专利类型	发明专利
公开（公告）号	CN106529204A	公开（授权）日	2017.03.22
申请（专利权）人	中国科学院计算技术研究所	发明（设计）人	尹吉澧;孟佳明;刘超;迟浩;陈镇霖;孙瑞祥;董梦秋;贺思敏
主分类号	G06F19/16(2011.01)I	IPC主分类号	G06F19/16(2011.01)I
专利有效期	一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法至一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法	法律状态	实质审查的生效
说明书摘要	本发明提供一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法，包括：1)分别对每个谱图进行单谱匹配和排序，得到对应的最优的交联二肽单谱匹配结果；提取当前每一个肽谱匹配结果的多谱匹配特征向量，其中包括SVM分数、母离子误差比例特征和修饰比例特征等动态特征；2)在所得到的交联二肽匹配结果中，取FDR在预设的FDR阈值以内的属于正样本的结果构建正样本库，取所有负样本的结果构建反样本库；基于新的训练样本更新各个多谱匹配特征向量；3)训练SVM分类器；4)用本轮训练后的SVM分类器对所有交联二肽结果进行重打分；5)根据预设的迭代条件判断是否继续进行迭代，结束迭代时基于当前SVM分数输出多谱排序结果。本发明的多谱排序方法灵敏度高且性能稳定。