专利详情

专利名称	一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统
申请号	CN201610941299.X	专利类型	发明专利
公开（公告）号	CN106248844A	公开（授权）日	2016.12.21
申请（专利权）人	中国科学院计算技术研究所	发明（设计）人	涂慧君;刘超;迟浩;贺思敏
主分类号	G01N30/86(2006.01)I	IPC主分类号	G01N30/86(2006.01)I
专利有效期	一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统至一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统	法律状态	实质审查的生效
说明书摘要	本发明提出一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统，涉及生物信息学，该方法包括对原始质谱数据文件进行搜索，获取肽段?谱图匹配作为鉴定结果，对于所述鉴定结果中FDR小于1％的来自目标库的肽段?谱图匹配，提取肽段?谱图匹配中相应肽段的实验保留时间，并设置训练样本与测试样本；使用所述训练样本，将带有修饰的氨基酸作为新氨基酸，建立多元线性回归模型，使用梯度下降法求解每种氨基酸的保留系数；对所述训练样本中的每条肽段，提取56维特征，并计算相应的特征值；建立预测模型，对所述测试样本中已知序列的肽段进行保留时间预测。本发明可以用于不同色谱条件下带有修饰的肽段的保留时间预测，大大提升了速度，在不同的数据集合上与Elude对比，速度加快了30倍以上。