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Genetic motif extracting method and apparatus

  • 申请号:US19940339233
  • 专利类型:US
  • 申请(专利权)人:中国科学院遗传与发育生物学研究所
  • 公开(公开)号:US5598350(A)
  • 公开(公开)日:1997.01.28
  • 法律状态:
  • 出售价格: 面议
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专利详情

专利名称 Genetic motif extracting method and apparatus
申请号 US19940339233 专利类型 US
公开(公告)号 US5598350(A) 公开(授权)日 1997.01.28
申请(专利权)人 中国科学院遗传与发育生物学研究所 发明(设计)人 KAWANISHI YUICHI (JP);GOJOBORI TAKASHI (JP);TATENO YOSHIO (JP);IKEO KAZUHO (JP);KAWAI MASAHITO (JP)
主分类号 G06F19/00 IPC主分类号 G06F19/00;C12Q1/6820060101A;G06F17/3020060101A;G06F159/00;G06F17/3020060101C;G06F19/0020060101A;C12Q1/6820060101C;G06F19/0020060101C
专利有效期 Genetic motif extracting method and apparatus 至Genetic motif extracting method and apparatus 法律状态
说明书摘要 A genetic motif extracting apparatus is adapted to extract a motif from genetic sequence information, where the motif has a regularity in a distinctive feature that specifies a genetic function. The genetic motif extracting apparatus includes a weight calculation unit for calculating a weight of each genetic sequence from a length of at least one branch of an evolution tree structure that is related to a plurality of genetic sequences, a score calculation unit for calculating a score that indicates a degree of similarity of sequence elements of the genetic sequences appearing at a site for each site of the genetic sequences using the weight calculated by the weight calculation unit, and a feature information extraction unit for extracting a part of the genetic sequence having the regularity in the distinctive feature as the motif based on the score calculated by the score calculation unit.

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