专利详情

专利名称	一种基于HCD与ETD质谱图的肽段从头测序方法及系统
申请号	CN201210501813.X	专利类型	发明专利
公开（公告）号	CN103852513A	公开（授权）日	2014.06.11
申请（专利权）人	中国科学院计算技术研究所;北京市生命科学研究所	发明（设计）人	迟浩;陈海丰;孙瑞祥;董梦秋;贺思敏
主分类号	G01N27/62(2006.01)I	IPC主分类号	G01N27/62(2006.01)I
专利有效期	一种基于HCD与ETD质谱图的肽段从头测序方法及系统至一种基于HCD与ETD质谱图的肽段从头测序方法及系统	法律状态	实质审查的生效
说明书摘要	本发明提供一种基于HCD与ETD质谱图的肽段从头测序方法及系统，该方法包括：步骤1，将HCD与ETD的质谱图对应起来形成一个新质谱图，对所述新质谱图进行预处理，检测出有效谱峰并删除干扰谱峰；步骤2，根据所述有效谱峰构建有向无环图；步骤3，在所述有向无环图中寻找符合权重规则的路径，并根据所述路径生成候选肽段；步骤4，将所述候选肽段与所述新质谱图进行匹配打分，按照打分结果将所述候选肽段进行排序并输出。本发明弥补了单种碎裂类型引起的谱峰不全的缺点，结合HCD与ETD谱图各自的优点，提高从头测序的准确度。同时在从头测序之前进行预处理，去除大量同位素谱峰与噪音谱峰，避免其对从头测序算法造成干扰。并利用更加有区分度的打分算法，提高了从头测序的性能。