专利详情

专利名称	开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统
申请号	CN201210451907.0	专利类型	发明专利
公开（公告）号	CN103810200A	公开（授权）日	2014.05.21
申请（专利权）人	中国科学院计算技术研究所	发明（设计）人	迟浩;孙瑞祥;王乐珩;张文力;贺思敏
主分类号	G06F17/30(2006.01)I	IPC主分类号	G06F17/30(2006.01)I
专利有效期	开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统至开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统	法律状态	实质审查的生效
说明书摘要	本发明有关于一种开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统，其中该方法包括：步骤1，输入蛋白质序列，模拟切分每一条蛋白质序列，并将所有生成的子序列按照质量排序，生成肽序列数据表，并根据该肽序列数据表建立索引文件；步骤2，输入质谱图，对每张质谱图，提取谱峰生成查询集合，查询所述索引文件，得到序列集合；步骤3，对每张质谱图及其对应的序列集合，根据修饰组合，生成候选肽段并打分；步骤4，对打分结果进行整合，并进行肽段到蛋白质的推断，得到鉴定结果。本发明允许用户不指定酶切和修饰的类型，或指定其中的任意类型进行蛋白质鉴定，用于解决任意类型的酶切和修饰的鉴定问题。