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一种蛋白质冷冻电镜密度图结构检测方法

  • 申请号:CN201110342503.3
  • 专利类型:发明专利
  • 申请(专利权)人:中国科学院计算机网络信息中心
  • 公开(公开)号:CN102682223A
  • 公开(公开)日:2012.09.19
  • 法律状态:实质审查的生效
  • 出售价格: 面议
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专利详情

专利名称 一种蛋白质冷冻电镜密度图结构检测方法
申请号 CN201110342503.3 专利类型 发明专利
公开(公告)号 CN102682223A 公开(授权)日 2012.09.19
申请(专利权)人 中国科学院计算机网络信息中心 发明(设计)人 迟学斌;单桂华;刘俊;田东;谢茂金
主分类号 G06F19/16(2011.01)I IPC主分类号 G06F19/16(2011.01)I
专利有效期 一种蛋白质冷冻电镜密度图结构检测方法 至一种蛋白质冷冻电镜密度图结构检测方法 法律状态 实质审查的生效
说明书摘要 本发明公开了一种蛋白质冷冻电镜密度图结构检测方法,属于生物信息学领域。本方法为:1)选取原子模型中符合条件的原子表示所选原子模型;2)选取待测蛋白质冷冻电镜密度图中的关键点并将其添加到集合M中;3)对于集合P中的每一点p,计算集合M中距离点p最近的点g作为点p的对应点并将其添加到集合G中;4)根据集合P、G计算原子模型的旋转四元数q和平移向量t;5)根据旋转四元数q计算旋转矩阵R,并根据R、t计算原子模型中每一原子坐标转换后的位置,得到原子模型与密度图的匹配结果;6)根据满足要求的匹配结果得到待测蛋白质冷冻电镜密度图的结构。本发明鲁棒性好,模型数据不必与密度数据重合,计算量小、易于编程实现。

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