专利详情

专利名称	一种系统进化树的重建方法
申请号	CN201310049516.0	专利类型	发明专利
公开（公告）号	CN103093118A	公开（授权）日	2013.05.08
申请（专利权）人	中国科学院计算机网络信息中心	发明（设计）人	黎建辉;孟珍;周园春;邵靖;曹巍
主分类号	G06F19/14(2011.01)I	IPC主分类号	G06F19/14(2011.01)I
专利有效期	一种系统进化树的重建方法至一种系统进化树的重建方法	法律状态	实质审查的生效
说明书摘要	本发明属于应用生物信息学技术领域，涉及一种系统进化树的重建方法。该方法首先选定特定的序列标记片段进行检索并筛选相关的序列数据并组织成.fasta格式文件作为基础数据集；随后对基础数据集进行基础系统发育树的构建并生成.XML系统发育树文件，同时构建基础BLAST库；然后综合基础数据集和新输入的自测序列数据进行系统发育树的重建并生成.XML文件，然后可视化和标注自测序列数据代表的样本物种在整棵大树中的位置等信息。该方法是一种基于初始大树构建和同源相似性比对的快速算法相结合的方法，可以用于生物系统发育、生物条形码、生物物种鉴定等相关领域的大系统发育树重建和web应用。